Герц прожил короткую жизнь. Сложные опыты подорвали его и без того хрупкое здоровье. Он ушел из жизни 1 января 1894 г. Генрих Герц оставил о себе добрую память. Хорошо его знавший Герман Гельмгольц позднее так отзывался о своем ученике: «...память о нем будет жить не только благодаря его работам, но и благодаря его личным достоинствам: его постоянной скромности, радостной готовности признать чужие заслуги, неизменной благодарности, которую он сохранил по отношению к своим учителям. <...> Он сам жаждал только истины, которой он следовал с высочайшей серьезностью и с полной отдачей сил. Никогда не было в его душе и тени тщеславия или личного интереса».