Det ægyptiske mysterium er historien om tre 12-årige detektiver; Göran, Katarina og bogens jeg-fortæller. Da Katarina hjælper sin far med at afhente pakker til hans auktionsforretning, opdager hun, at en af pakkerne er uden afsender. Den viser sig at indeholde en flere tusind år gammel egyptisk statue lavet af guld.