Den katolske præst og hemmelige agent Anthony Fowler opsøger en nazistisk krigsforbryder som lever under pseudonym p.g.a. sine grusomme forsøg med jødiske børn under krigen. Fowler vil slå en handel af: Mod at undlade at afsløre mandens sande identitet kræver han et gammelt alterlys overtrukket med guldfiligran. Det er dog ikke guldet, som interesserer Fowler, men det fragment af et kort, som er støbt ind i lyset.
Snart er fader Fowler involveret i en ekspedition til Jordans ørken med det formål at finde Pagtens Ark, Moses tavler med de ti bud. Ekspeditionen organiseres og finansieres af en mystisk multimillionær, og udover Fowler, som er Vatikanets officielle observatør, en række teknikere og arkæologer deltager journalisten Andrea Otero, der tror hun skal skrive sit livs historie.
Men der er en forræder i blandt dem, og ekspeditionen bliver hurtigt forfulgt af uheld og underlige dødsfald. En forræder med stor viden om ekspeditionen og forbindelser til en magtfuld terrororganisation, som for alt i verden vil forhindre at Pagtens Ark kommer for dagens lys.