La generación de Geb y Nut también estuvo formada solo por dos dioses, así que parecía que de nuevo la tercera generación de dioses estaba destinada a que permanecieran juntos para siempre, pero hubo problemas con la unión entre Geb y Nut. Según una versión del mito, Shu no estuvo de acuerdo con la relación incestuosa de sus hijos y les ordenó que se mantuvieran separados.