Efterår. Under en stærk storm sidder en kvinde alene i sin villa. Isoleret. Deprimeret. Mentalt hårdt presset af en dyb hemmelighed, hendes mand har indviet hende i, begår hun selvmord. Politianmeldelsen kommer fra naboen.
Kriminalassistent Christian Krake bliver sendt ud for at undersøge forholdet. Han ender med at stå med en uhyre vanskelig sag, dele af kriminalpolitiet i København har kendt til igennem fire måneder, men uden at kunne opklare. Krake finder ud af, hvilken forrykt handling kvindens mand, en major, dækker over – og hvorfor kriminalpolitiet ikke har kunnet opklare sagen.
Majorens sidste hilsen er fjerde bind i serien om kriminalbetjenten Christian Krake. Bøgerne kan læses hver for sig.